微波干燥設備的微波是在電真空器件或半導體器件上通以直流電或50Hz的交流電,利用電子在磁場中作特殊運動來獲得的。它的這種運動可以簡單的這樣來解釋一下:介質從電結構看,一類分子叫無極分子電介質,另一類叫有極分子電介質。在一般情況下,它們都呈無規則排列,如果把它們置于交變的電場之中,這些介質的極性分子取向也隨著電場的極性變化而變化,這就叫做極化。
微波干燥設備的外加電場越強,極化作用也就越強,外加電場極性變化得越快,極化得也越快,分子的熱運動和相鄰分子之間的摩擦作用也就越劇烈。在此過程中即完成了電磁能向熱能的轉換,當被加熱物質放在微波場中時,其極性分子隨微波頻率以每秒幾十億次的高頻來回擺動、摩擦,產生的熱量足以使物料在很短的時間內達到熱干的目的。
微波干燥對于均相體系，傳質傳熱較好；對于非均相體系，傳質傳熱受到一定影響。用于中藥干燥時，應考慮物料的適用情況，包括藥物成分及其性質、含水量、物料形態、物料量、物料厚度等，選擇溫度分布均勻性符合要求的微波干燥設備，開展干燥工藝的研究，應關注微波干燥的過熱效應，關注微波干燥對高分子物質（蛋白質等）、熱敏性成分、揮發性成分、毒性成分等的影響，關注對藥物成分的相互作用、生物活性等的影響，確定合理的功率、功率密度、溫度、時間等參數及終點判斷指標，并進行工藝驗證。當微波干燥技術與其他干燥技術聯合使用時，應根據所選設備、方法的特點進行研究，并根據研究結果合理選擇。
微波干燥除了熱效應外，還可能存在非熱效應，目前微波干燥對藥物成分的影響程度、影響規律尚不十分明確。微波干燥工藝的選擇，應考慮物料的性質及其對微波技術的適用性，在充分研究的基礎上根據具體品種的比較研究結果確定。
